خلاصه داستان : هلیوپولیس، کلونى فضایى معروف که مرکز تحقیقات و اسلحه سازى پیشرفته اى در خود جاى داده است و گاندم هایى براى نیروهاى زمین میسازد. زافت ها که به کوردینیتور (از لحاظ ژنتیکى نسبت به انسانهاى معمولى ارتقا یافته اند) نیز معروف هستند، به هلیوپولیس حمله کرده و ۴ عدد از ۵ گاندم ساخته شده در کارخانه را سرقت میکنند. در طول نبرد، شهروندى از هلیوپولیس به اسم کیرا یاماتو به طور اتفاقى وارد جنگ شده و مجبور به هدایت آخرین گاندم باقی مانده میشود. در خلال نبرد با بهترین دوست دوران کودکى خود آسورا زالا روبرو شده که همرزم با نیروهاى زافت شده است و نیز یک کوردینیتور و یکی از اعضاى گروه سرقت کننده گاندم ها می باشد، کیرا تنها کسى هست که میتونه گاندم رو هدایت کنه ولی به نیروهاى زافت یا زمین نمی پیونده. او از گاندم استفاده میکنه تا دوستانشو از خطر نجات بده و حتی با بهترین دوستش مبارزه میکنه و …

In this era, mankind has developed into two subspecies: Naturals, who reside on Earth and Coordinators, genetically-enhanced humans capable of withstanding the rigors of space who inhabit orbital colonies. The story revolves around a young Coordinator Kira Yamato who becomes involved in the war between the two races after a neutral space colony is invaded by the Coordinators.